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聚焦長三角

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浙大婦院團隊《科學》發(fā)文:遠古病毒碎片竟是胚胎發(fā)育的關鍵因素?

在生命最初的旅程中,一個受精卵需要經(jīng)歷一系列精密而復雜的發(fā)育階段,才能最終成長為一個完整的個體。然而,在輔助生殖過程中,許多胚胎在植入子宮前就停止了發(fā)育,尤其在8細胞期(8C)階段,這一發(fā)育驟?,F(xiàn)象成為生殖醫(yī)學領域長期未解的難題。如今,這一難題有了關鍵線索。

北京時間1月23日,浙江大學基礎醫(yī)學院/浙江大學醫(yī)學院附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院研究員、長聘副教授梁洪青,浙江大學醫(yī)學院附屬婦產(chǎn)科醫(yī)院主任醫(yī)師、教授張丹,聯(lián)合同濟大學高紹榮院士以及浙江大學愛丁堡大學聯(lián)合學院長聘副教授劉琬璐團隊在國際頂尖期刊《科學》發(fā)表文章,首次揭示了人類基因組里“遠古病毒化石”(內源性逆轉錄病毒,ERV),通過合成特殊的“嵌合RNA”,幫助人類早期胚胎順利跨越合子基因組激活(ZGA)關鍵發(fā)育節(jié)點。該研究不僅深化了對生命起源的理解,也為改善輔助生殖技術提供了新思路。

臨床之困:胚胎為何過不了“第三天”這個坎?

“醫(yī)生,為什么我的胚胎總是剛開始發(fā)育就停了?”在浙大婦院生殖內分泌科的診室里,張丹經(jīng)常聽到這樣的疑問。作為國內頂尖的生殖醫(yī)學專家,她和團隊每年要接待數(shù)千個不孕家庭,其中有一些患者會遇到早期胚胎發(fā)育阻滯的問題——體外受精形成的胚胎,在發(fā)育到受精后第三天(8細胞階段)時,突然“卡殼”,既不繼續(xù)分裂,也無法發(fā)育為囊胚,最終失去移植價值——這是困擾生殖醫(yī)學領域多年的“胚胎發(fā)育阻滯”難題,也是無數(shù)不孕家庭的痛點。

“一開始,我們以為是編碼基因出了問題。”張丹回憶道。人類基因組里有2萬多個編碼基因,就像“生產(chǎn)蛋白質的說明書”,之前的研究大多認為,若這些基因發(fā)生突變,可能導致胚胎發(fā)育異常。

令人困惑的是,許多發(fā)育阻滯的胚胎,通過外顯組測序、家族遺傳分析等檢查方式,并未發(fā)現(xiàn)編碼基因有特別異常——染色體沒問題,已知的與早期胚胎發(fā)育相關的基因突變也未出現(xiàn),可胚胎就是“活不下去”。“我們無法解釋這一現(xiàn)象。這種‘無解’的狀態(tài),對醫(yī)生和患者都是一種煎熬?!睆埖ふf。這也讓研究團隊陷入思考:難道基因組里還有未知領域在影響胚胎發(fā)育?

與梁洪青團隊的碰撞,為這個問題帶來了新視角。2019年,長期研究干細胞與轉錄調控的浙江大學基礎醫(yī)學院研究員梁洪青雙聘到浙大婦院,與張丹團隊頻繁交流學術問題?!盎蚪M里非編碼區(qū)還有超過40%的 ‘暗物質’——逆轉座子序列,其中內源性逆轉錄病毒(ERV)是一個重要的分支?!绷汉榍嗾f,ERV是遠古病毒感染人類祖先留下的“基因化石”,雖然大多失去了感染能力,但可能在進化中被“馴化”,參與生命活動。

與此同時,研究人員觀察到,在人類體外受精胚胎的8細胞“瓶頸期”,胚胎想要繼續(xù)往下發(fā)展,需要一股“洪荒之力”——成功啟動自身的基因表達程序,即“合子基因組激活”(ZGA),這樣才能實現(xiàn)從依賴卵子儲存的母源物質到激活自身基因組的切換。ZGA如同生命啟動的“總開關”,一旦失敗,胚胎發(fā)育便會阻滯于此。

“已知的、負責編碼蛋白質的基因中,僅有少數(shù)幾十個被發(fā)現(xiàn)與早期胚胎發(fā)育調控直接相關。對于大量臨床上找不到編碼基因突變的發(fā)育阻滯案例,我們推測,問題的答案可能隱藏在占據(jù)基因組絕大部分、功能未知的‘非編碼區(qū)’?!睆埖そ忉尩?。

臨床的迫切需求與基礎研究的探索在此交匯,雙方都覺得這是一個很有意思也很有想象力的好問題。團隊決定從合子基因組階段特異性高表達的ERV入手,對比正常胚胎和發(fā)育阻滯胚胎的差異。結果令人驚喜:在發(fā)育阻滯的8細胞胚胎中,ERV家族里的MLT2A1的亞家族,表達量比正常胚胎顯著下調!“這似乎找到一個關鍵線索——MLT2A1的‘缺席’,可能正是胚胎‘卡殼’的原因?!绷汉榍啾硎尽S纱?,團隊鎖定了進一步的研究目標:探索MLT2A1如何影響胚胎發(fā)育。

創(chuàng)新突破:“遠古病毒化石”變身,解鎖胚胎啟動的3大密碼

要弄清楚MLT2A1的作用,首先得看清它在胚胎里“做什么”。團隊采用了納米孔長讀長測序技術——相當于給RNA拍“全身照”,能完整讀出它的序列,不遺漏細節(jié)。該技術的應用帶來了第一個重大發(fā)現(xiàn):MLT2A1在ZGA階段并非孤立地表達自己,而是主動地與下游各種不同的基因組序列“手拉手”融合,形成了一系列結構特殊的“嵌合RNA”。

“這徹底顛覆了我們的認知?!闭撐墓餐谝蛔髡?、浙大婦院博士后向陽泉感嘆,“就像一把鑰匙,原本只有一種齒形,卻能搭配不同的‘齒套’,變成無數(shù)種鑰匙?!毖芯拷Y果顯示,MLT2A1的“主體”是固定的,但會和下游的編碼基因、非編碼序列,甚至其他逆轉座子融合。研究人員在人類8細胞期胚胎和干細胞中鑒定出幾百種不同的嵌合轉錄本,這些嵌合RNA平均長度在500-1000堿基之間,絕大多數(shù)通過剪接事件連接而成。

這意味著,MLT2A1通過這種廣泛的“嵌合”模式,極大地拓展了其RNA序列的復雜性和多樣性。原本只有3800多種相似“鑰匙”,現(xiàn)在變成了能打開基因組中成千上萬把不同“連環(huán)鎖”的“萬能鑰匙串”。

那么,這些“嵌合RNA”如何具體行使功能?研究團隊揭開了第二個關鍵機制:MLT2A1 RNA主要富集在細胞核內。在同濟大學高紹榮院士的支持下,團隊揭示了它們利用其嵌合特性,能夠精準地靶向并結合到基因組上大量與ZGA相關的位點。

更關鍵的是,MLT2A1 RNA并非“單打獨斗”。它通過其保守的序列區(qū)域,招募了一個重要的核內蛋白“幫手”——HNRNPU。兩者形成的復合物,又能進一步招募負責基因轉錄的“核心機器”——RNA聚合酶II。

“它們就像一組緊密咬合的‘命運齒輪’,”張丹形容,“一個齒輪轉動,會帶動周圍所有齒輪一起轉動。這種自我放大和集體行動的機制,確保了在ZGA這個關鍵時間窗口,能夠快速、強勁地啟動全局性的基因表達程序,幫助胚胎順利跨越發(fā)育瓶頸。”

價值深遠:不止于“讀懂”胚胎,更打開生殖健康新視野

從門診中碰到早期胚胎發(fā)育阻滯的病例,到臨床與基礎研究團隊互相啟發(fā)擦出創(chuàng)新的火花,在張丹和梁洪青看來就像是一個偵探破案的過程,“浙江大學和浙大婦院都有著交叉創(chuàng)新與開放合作的科研氛圍,不同研究背景的專家是真正的‘人在一起’地工作,擴大了各自的研究領域?!倍@項融合了基礎和臨床的研究,意義也是多重的。

首先,它深化了我們對生命起源的理解。研究首次令人信服地揭示,曾被忽視的基因組“暗物質”——內源性逆轉錄病毒,在人類生命最初的塑造過程中,扮演了積極主動且至關重要的角色,為發(fā)育生物學提供了全新的認知視角。

其次,它為改善輔助生殖技術提供了全新的科學思路和潛在的未來路徑。張丹表示:“未來,如果能通過對MLT2A1等分子的檢測,更早、更精準地預測胚胎活力,將有助于我們篩選出最優(yōu)質的胚胎進行移植,從而提高試管嬰兒的成功率?!?/p>

另一方面,這項研究為理解并干預因ZGA失敗導致的胚胎發(fā)育阻滯奠定了一定的理論基礎。張丹表示,“未來或許可以通過優(yōu)化體外培養(yǎng)體系,模擬更接近體內的環(huán)境,來更好地支持胚胎自身基因組的激活程序,幫助更多胚胎順利發(fā)育?!?/p>

當然,研究人員也強調,從基礎研究的突破到真正的臨床應用尚有很長的路要走。未來,浙大婦院的研究團隊將繼續(xù)深入研究,努力為眾多遭受不明原因胚胎發(fā)育阻滯困擾的家庭提供未來希望。

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